More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1929 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.28 
 
 
1877 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.75 
 
 
831 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.95 
 
 
1402 aa  135  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.95 
 
 
684 aa  135  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.57 
 
 
789 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.26 
 
 
961 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.96 
 
 
489 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.62 
 
 
464 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.64 
 
 
305 aa  121  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.13 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
448 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.99 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.21 
 
 
392 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
1032 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.5 
 
 
1493 aa  116  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.8 
 
 
685 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.47 
 
 
341 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.92 
 
 
557 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 
346 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.64 
 
 
490 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.77 
 
 
731 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.5 
 
 
490 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 
1037 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.46 
 
 
373 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
303 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.56 
 
 
1002 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.41 
 
 
245 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.06 
 
 
264 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.67 
 
 
329 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.5 
 
 
380 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.67 
 
 
331 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.18 
 
 
376 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.02 
 
 
373 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.46 
 
 
416 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.56 
 
 
380 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.32 
 
 
316 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
252 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.84 
 
 
2413 aa  99.4  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.98 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.37 
 
 
267 aa  99  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.7 
 
 
376 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.02 
 
 
282 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.5 
 
 
971 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
971 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  34.71 
 
 
1910 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.05 
 
 
342 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  41.52 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.68 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 
528 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.86 
 
 
482 aa  95.5  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.14 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.17 
 
 
358 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.72 
 
 
325 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.18 
 
 
315 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.84 
 
 
359 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.55 
 
 
838 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.82 
 
 
331 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.07 
 
 
325 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 
325 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.82 
 
 
331 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  34.85 
 
 
274 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 
798 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.82 
 
 
331 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.29 
 
 
327 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.16 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  33.55 
 
 
185 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30.58 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  32.23 
 
 
401 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
523 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.92 
 
 
512 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 
487 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.05 
 
 
348 aa  89  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 
680 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  32.58 
 
 
304 aa  88.6  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
976 aa  88.2  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.43 
 
 
679 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  25.88 
 
 
552 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.7 
 
 
1044 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 
865 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
1430 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30.7 
 
 
1078 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.1 
 
 
380 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.44 
 
 
278 aa  86.3  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  38.74 
 
 
117 aa  85.5  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  31.92 
 
 
415 aa  85.1  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  30.52 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.4 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.06 
 
 
1200 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  29.1 
 
 
1141 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.88 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  27.06 
 
 
1200 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.45 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  30.96 
 
 
1281 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>