More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0483 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  70 
 
 
514 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  97.46 
 
 
511 aa  988    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  66.86 
 
 
512 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  66.27 
 
 
512 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0538  hypothetical protein  74.51 
 
 
512 aa  737    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
511 aa  1039    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  96.87 
 
 
511 aa  983    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  66.47 
 
 
512 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  97.65 
 
 
511 aa  991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.94 
 
 
961 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.66 
 
 
684 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.57 
 
 
1402 aa  121  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30 
 
 
789 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.36 
 
 
376 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.36 
 
 
376 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 
831 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 
392 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
416 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.23 
 
 
490 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
976 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.23 
 
 
490 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.62 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.69 
 
 
557 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.73 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 
448 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.97 
 
 
2413 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.72 
 
 
552 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.83 
 
 
838 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.87 
 
 
1877 aa  94.4  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.21 
 
 
425 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.33 
 
 
505 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.15 
 
 
865 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.8 
 
 
1200 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.66 
 
 
393 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.48 
 
 
1200 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.24 
 
 
316 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.04 
 
 
1037 aa  88.6  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
1032 aa  88.6  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.33 
 
 
235 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.7 
 
 
305 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.69 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.77 
 
 
1493 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.74 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 
890 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.18 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.27 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 
523 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.02 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.74 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  24.48 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  24.48 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.17 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30.35 
 
 
1078 aa  80.5  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.84 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.9 
 
 
798 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.21 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.35 
 
 
1044 aa  80.5  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.52 
 
 
256 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
301 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  26.81 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 
222 aa  79  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.91 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.41 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.54 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  23.74 
 
 
509 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.87 
 
 
267 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  31.09 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  31.09 
 
 
362 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
303 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.21 
 
 
276 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.69 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.56 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.54 
 
 
1002 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.77 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  33.78 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.84 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.86 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.39 
 
 
971 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  26.86 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  30.34 
 
 
293 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 
270 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  25.64 
 
 
850 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.73 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  25.23 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.34 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.51 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.9 
 
 
971 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>