203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2985 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 504 aa  1013    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  31.29 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  30.89 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  31.21 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0538  hypothetical protein  31.53 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  31 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  30.26 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  32.29 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.09 
 
 		 684 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.67 
 
 		 831 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1402 aa  89  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.76 
 
 		 961 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  25.33 
 
 		 789 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.42 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.48 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  24.29 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.64 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 		 890 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1032 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  24.65 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  31.71 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.27 
 
 		 838 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  25.63 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.17 
 
 		 839 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.28 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1493 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.51 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  33 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.32 
 
 		 490 aa  67  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.64 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.36 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.32 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 976 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.35 
 
 		 865 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.95 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.22 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.37 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.78 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.36 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  30.87 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1002 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  29.91 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1877 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  25 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 512 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  36.11 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 		 798 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.5 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  26.47 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.35 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.96 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30.92 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.81 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.66 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  34.53 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25.4 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  31.31 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  27.07 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  30.81 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  28.91 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  28.64 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  22.4 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  23.48 
 
 		 1200 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.49 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.82 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.41 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.98 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.98 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  26.13 
 
 		 331 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  24.41 
 
 		 362 aa  57  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  24.41 
 
 		 362 aa  57  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  29.36 
 
 		 679 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  25.88 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.08 
 
 		 255 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  25.99 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.13 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  33.92 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  27.07 
 
 		 208 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.72 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  22.09 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  30.85 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  25.16 
 
 		 961 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.19 
 
 		 348 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  29.41 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  26.18 
 
 		 536 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  30.81 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>