121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4564 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  96.14 
 
 		 484 aa  854    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1240  alginate biosynthesis protein AlgK  69.26 
 
 		 470 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0957  Sel1 repeat-containing protein  71 
 
 		 468 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  96.14 
 
 		 477 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 516 aa  1037    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  94.21 
 
 		 475 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1060  Sel1 repeat-containing protein  68.83 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18520  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  59.77 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119912  normal  0.727737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1602  alginate biosynthetic protein AlgK precursor  59.31 
 
 		 475 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10940  Alginate biosynthetic protein AlgK  56.5 
 
 		 457 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1028  Sel1 domain-containing protein  56.76 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  34.27 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.43 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2985  Sel1 domain-containing protein  31.31 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1402 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.91 
 
 		 789 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.99 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25 
 
 		 961 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.09 
 
 		 684 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.56 
 
 		 382 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 241 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 213 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1366 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  38.04 
 
 		 267 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.02 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  30.84 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  34.34 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  34.34 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  34.34 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  34.34 
 
 		 722 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1037 aa  51.2  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  32.46 
 
 		 366 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  26.72 
 
 		 254 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.52 
 
 		 831 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.09 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.84 
 
 		 680 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  32.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.04 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.88 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.94 
 
 		 890 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 997 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.97 
 
 		 865 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.19 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 184 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  27.05 
 
 		 181 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  25.53 
 
 		 278 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.91 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4315  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.46 
 
 		 208 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.85 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  26.15 
 
 		 817 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0906  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 249 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.52 
 
 		 318 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  26.23 
 
 		 181 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  36.99 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1493 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  37.08 
 
 		 357 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.55 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 303 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.99 
 
 		 232 aa  47  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.77 
 
 		 693 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  25.6 
 
 		 182 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  30.19 
 
 		 365 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.19 
 
 		 321 aa  47  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  34.83 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  40 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0893  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.131651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.63 
 
 		 838 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  34.88 
 
 		 1105 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1134  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  35.62 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.52 
 
 		 2413 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  27.48 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.38 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.97 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.33 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.76 
 
 		 1078 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.65 
 
 		 267 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  28.26 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  31.03 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  28.26 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  28.26 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.26 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1002 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>