More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3011 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 425 aa  85.5  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.99 
 
 		 489 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.21 
 
 		 789 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.33 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.78 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.24 
 
 		 557 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.34 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  30.93 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31 
 
 		 838 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  30.9 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  32.19 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.19 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  33.01 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.8 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  35.88 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.72 
 
 		 961 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  30.54 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.45 
 
 		 684 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1402 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2413 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  32.84 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.25 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 		 865 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.04 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  35.29 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1037 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.11 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  31.31 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.94 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1877 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  31.12 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.87 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.12 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.95 
 
 		 528 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.13 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 1032 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1602  Mrr restriction system protein (EcoKMrr)  33.56 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.492823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 976 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1141 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 1430 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  32.32 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.89 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.87 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.49 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.09 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  29.61 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  31.87 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.53 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1493 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.78 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.15 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.41 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  31.08 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 505 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.11 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  31.08 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  31.97 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.27 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.87 
 
 		 490 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  32.28 
 
 		 985 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.9 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  26.02 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.89 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.07 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  29.84 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1281 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39.47 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  25.65 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>