242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1687 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 268 aa  533  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  59.48 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  59.05 
 
 		 267 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  57.76 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  55.23 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.61 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.21 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  51.27 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.06 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.41 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  38.15 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.45 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.4 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  36.36 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  40.95 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  40.28 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.57 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  40.48 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  40.48 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  40 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1402 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 831 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.76 
 
 		 789 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.76 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1032 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.54 
 
 		 2413 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.16 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.42 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1037 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.13 
 
 		 557 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.34 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 416 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.44 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.73 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.1 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1493 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.79 
 
 		 961 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.71 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.84 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.21 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.28 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.81 
 
 		 680 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 528 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  30.82 
 
 		 839 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.65 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 976 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  28.9 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 890 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.82 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.73 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.87 
 
 		 685 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.75 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.9 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  34.36 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  30.45 
 
 		 380 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.26 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  32.45 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  25.14 
 
 		 850 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.72 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.89 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  41.25 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.12 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  31.98 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  31.9 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.7 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.49 
 
 		 838 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  28.3 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  32.7 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.68 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.57 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.57 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 817 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 1261 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>