162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4455 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  78.75 
 
 		 273 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  75.42 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  77.92 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  74.17 
 
 		 267 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  76.09 
 
 		 273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  79 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  59.28 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.27 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  54.11 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.23 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.23 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  50.23 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  50.95 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.06 
 
 		 280 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  42.36 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  41.87 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  40.28 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  38.94 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  38.03 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  36.45 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.24 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.62 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.4 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1402 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.14 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.21 
 
 		 2413 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.95 
 
 		 684 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.96 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.96 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.42 
 
 		 961 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.08 
 
 		 1078 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.08 
 
 		 1044 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.86 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.11 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.03 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 831 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.11 
 
 		 838 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.24 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.01 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.4 
 
 		 890 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  30.06 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1037 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.86 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.21 
 
 		 425 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 		 557 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.87 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.81 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.27 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  28.87 
 
 		 482 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 		 865 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.41 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1493 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.41 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 448 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.8 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1032 aa  55.1  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.5 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.21 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.32 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.7 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1877 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.49 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.9 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  42.86 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.1 
 
 		 360 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.74 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  25.14 
 
 		 329 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1059 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  28.78 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.03 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  38.32 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.3 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  29.33 
 
 		 344 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1200  Sel1 domain-containing protein  26.69 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260547  hitchhiker  0.00269279 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  27.17 
 
 		 839 aa  49.3  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 817 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.77 
 
 		 811 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 		 350 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.52 
 
 		 1012 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  28.74 
 
 		 763 aa  48.9  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 		 321 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>