289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1200 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1200  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260547  hitchhiker  0.00269279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0627  Sel1 domain protein repeat-containing protein  56.76 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0876811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0220  Sel1 repeat-containing protein  45.22 
 
 		 276 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.94 
 
 		 789 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1402 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.57 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.95 
 
 		 489 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.38 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.76 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.3 
 
 		 684 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.95 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1032 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.84 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.11 
 
 		 961 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 		 685 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.74 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.81 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.8 
 
 		 557 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.5 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.49 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.49 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.27 
 
 		 464 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.49 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.73 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.49 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1037 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.98 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.9 
 
 		 528 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.84 
 
 		 490 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.5 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.69 
 
 		 693 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  27.09 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1877 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.53 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.98 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.98 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1002 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.9 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  25.42 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  23.44 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  23.44 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  23.33 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.49 
 
 		 838 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  28.06 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.11 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  25.45 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  24.77 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1493 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.84 
 
 		 2413 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  28.36 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.8 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.63 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.98 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 705 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  29.29 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.22 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  28.22 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.87 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1796 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.74 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.62 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  27.08 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.42 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.89 
 
 		 1012 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  25.66 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  27.49 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  26.2 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.13 
 
 		 865 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.73 
 
 		 961 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1141 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  25 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  27.49 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.23 
 
 		 376 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  29.78 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 117 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  26.24 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  26.02 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.62 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.02 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.51 
 
 		 343 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.73 
 
 		 376 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  38.36 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 172 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2484  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.6 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  29.35 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  28.27 
 
 		 403 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>