265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2495 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  77.78 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  78.15 
 
 		 273 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  79.7 
 
 		 273 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  80.57 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  79.92 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  74.17 
 
 		 240 aa  358  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  59.11 
 
 		 310 aa  261  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  59.18 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  58.67 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  55 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  49.05 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  54.95 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  53.5 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.71 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  39.85 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  39.47 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  39.34 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  37.6 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  35.8 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1402 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.98 
 
 		 789 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.02 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  32.84 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.87 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.51 
 
 		 2413 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.33 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.67 
 
 		 961 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.11 
 
 		 890 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1037 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.36 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.46 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.14 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 831 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.77 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 		 416 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.3 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.19 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 557 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.7 
 
 		 838 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.84 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.62 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.52 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.9 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.84 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.49 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  27.41 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.92 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 		 380 aa  62  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.52 
 
 		 490 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.57 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1032 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1493 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.09 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.67 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  26.04 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  31.48 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.47 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.91 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.11 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.95 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.03 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.07 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  35.45 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.94 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1002 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.76 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  38.52 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 647 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  32.72 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 		 685 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  28.8 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  30.82 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1160 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3904  Sel1  33.04 
 
 		 571 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190521  decreased coverage  0.00495215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.92 
 
 		 380 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.3 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 448 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.45 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.14 
 
 		 464 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  27.18 
 
 		 839 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>