255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1863 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  61.79 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.43 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.55 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  49.17 
 
 		 269 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  48.77 
 
 		 300 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  43.79 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  45 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.13 
 
 		 295 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  54.46 
 
 		 267 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.64 
 
 		 273 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  44.92 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  43.93 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  50.95 
 
 		 240 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  50.24 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  45.49 
 
 		 256 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  37.78 
 
 		 267 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  37.41 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  35.71 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  33.8 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  35.59 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.63 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1402 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.22 
 
 		 684 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.52 
 
 		 961 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  30.54 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.45 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.05 
 
 		 2413 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.8 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.11 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.3 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1037 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.5 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.59 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.67 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.14 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.36 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 557 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.06 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.06 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.4 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.72 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 		 865 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.24 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.28 
 
 		 838 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.55 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.83 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.7 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  33.09 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.64 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.61 
 
 		 890 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1877 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.94 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.76 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 		 971 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  30.25 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00810  ubiquitin-protein ligase Sel1/Ubx2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14690)  29.07 
 
 		 1121 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.188237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  30.86 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  29.76 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1002 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.65 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.79 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  28.98 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  31.37 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.42 
 
 		 1263 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 860 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.12 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.18 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  32.81 
 
 		 117 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.26 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.83 
 
 		 859 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.43 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  28.24 
 
 		 175 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.57 
 
 		 693 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.38 
 
 		 512 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.19 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 		 184 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  36.97 
 
 		 817 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>