More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0204 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  706    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.94 
 
 		 393 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.8 
 
 		 684 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.96 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.87 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 246 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.55 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.49 
 
 		 831 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  43.05 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.07 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.95 
 
 		 1012 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.29 
 
 		 789 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.06 
 
 		 961 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 528 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.39 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.97 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.06 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.22 
 
 		 1402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1037 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.98 
 
 		 264 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.91 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.34 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.74 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.41 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.58 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.27 
 
 		 2413 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.14 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.2 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  44.09 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.7 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  38.41 
 
 		 731 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.24 
 
 		 1261 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35 
 
 		 838 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.6 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.29 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  33.68 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.6 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.42 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  41.13 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 1196 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.4 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.59 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1877 aa  98.6  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  32.09 
 
 		 202 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.38 
 
 		 1263 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.22 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.65 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.49 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.99 
 
 		 193 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.15 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.49 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.19 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1002 aa  97.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 		 380 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 		 380 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1110 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.84 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.67 
 
 		 1493 aa  94.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  32.8 
 
 		 1081 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  30.41 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.78 
 
 		 222 aa  94  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.18 
 
 		 552 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  39.6 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  37.25 
 
 		 591 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.74 
 
 		 172 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1032 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  28.96 
 
 		 978 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 509 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  30.69 
 
 		 509 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.69 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  30.09 
 
 		 1086 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  34.21 
 
 		 763 aa  89.4  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1088 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.23 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1059 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.38 
 
 		 1260 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1110 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.14 
 
 		 163 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 		 1145 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 1226 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.23 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1160 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  28.98 
 
 		 839 aa  86.3  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 		 1242 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.61 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.19 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 817 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>