More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3098 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  69.98 
 
 
1199 aa  1282    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
1242 aa  2341    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  45.42 
 
 
1081 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  40.8 
 
 
1145 aa  592  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.44 
 
 
1110 aa  589  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.62 
 
 
1088 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  28.6 
 
 
1059 aa  249  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  31.16 
 
 
978 aa  230  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  30.43 
 
 
1086 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.33 
 
 
1196 aa  214  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.19 
 
 
1110 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.02 
 
 
1263 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.59 
 
 
1012 aa  191  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.01 
 
 
1261 aa  190  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  42.63 
 
 
1003 aa  188  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  38.46 
 
 
1160 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.29 
 
 
913 aa  182  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  50.53 
 
 
1105 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  49.02 
 
 
1134 aa  181  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  51.78 
 
 
1105 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  43.84 
 
 
1275 aa  172  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.5 
 
 
1226 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.94 
 
 
884 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  46.7 
 
 
795 aa  138  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.86 
 
 
1072 aa  125  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  44.72 
 
 
416 aa  120  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.82 
 
 
961 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.59 
 
 
831 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.11 
 
 
1402 aa  108  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.98 
 
 
684 aa  108  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.47 
 
 
490 aa  107  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.42 
 
 
305 aa  106  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.47 
 
 
490 aa  105  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.86 
 
 
789 aa  104  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.98 
 
 
235 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
303 aa  102  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 
318 aa  99.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.56 
 
 
489 aa  99.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.22 
 
 
241 aa  98.2  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
1032 aa  97.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.32 
 
 
185 aa  97.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
448 aa  96.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.24 
 
 
1877 aa  97.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.97 
 
 
438 aa  95.9  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 
321 aa  95.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.9 
 
 
376 aa  95.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.85 
 
 
557 aa  95.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  39.35 
 
 
393 aa  94.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.36 
 
 
997 aa  94.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.26 
 
 
376 aa  93.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  93.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.29 
 
 
1037 aa  94  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.62 
 
 
264 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.76 
 
 
193 aa  93.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
181 aa  93.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.12 
 
 
331 aa  92  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  91.7  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.97 
 
 
325 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.01 
 
 
1493 aa  90.9  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.18 
 
 
685 aa  90.9  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.97 
 
 
325 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  30.14 
 
 
344 aa  90.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.18 
 
 
267 aa  89.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  37.25 
 
 
373 aa  89.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.43 
 
 
331 aa  90.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.39 
 
 
246 aa  89.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.86 
 
 
331 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
343 aa  89  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  39.79 
 
 
1910 aa  88.6  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 
528 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 
346 aa  89  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.86 
 
 
331 aa  88.6  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  40 
 
 
232 aa  88.6  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.76 
 
 
325 aa  87.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.85 
 
 
380 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.53 
 
 
278 aa  87.4  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.35 
 
 
255 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.41 
 
 
358 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.84 
 
 
252 aa  86.7  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.6 
 
 
373 aa  86.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.36 
 
 
285 aa  86.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.74 
 
 
327 aa  86.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.89 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.76 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.18 
 
 
2413 aa  85.1  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.95 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
1430 aa  84.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.08 
 
 
271 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 
380 aa  84  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.32 
 
 
731 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32.9 
 
 
763 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.89 
 
 
208 aa  82.8  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.36 
 
 
274 aa  82  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 
341 aa  82  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
464 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.97 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 
254 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.82 
 
 
838 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.12 
 
 
359 aa  80.1  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
223 aa  80.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>