More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3442 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  74.18 
 
 		 1145 aa  1400    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 1088 aa  2089    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  73.6 
 
 		 1110 aa  1384    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  47.77 
 
 		 1081 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  58.1 
 
 		 1242 aa  302  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1199 aa  301  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  31.81 
 
 		 1059 aa  233  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.81 
 
 		 1110 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  30.96 
 
 		 978 aa  208  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.41 
 
 		 1196 aa  204  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  27.5 
 
 		 1086 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.23 
 
 		 1012 aa  181  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  50.88 
 
 		 1105 aa  178  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1160 aa  175  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  49.71 
 
 		 1134 aa  175  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  53.19 
 
 		 1105 aa  173  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  55.56 
 
 		 1003 aa  172  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.4 
 
 		 1263 aa  169  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.16 
 
 		 1260 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.7 
 
 		 1226 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.41 
 
 		 913 aa  159  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1275 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.22 
 
 		 884 aa  148  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  40.09 
 
 		 795 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 1072 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 416 aa  104  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.13 
 
 		 997 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.42 
 
 		 305 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.44 
 
 		 831 aa  99.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.9 
 
 		 241 aa  97.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.48 
 
 		 684 aa  95.9  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1037 aa  95.5  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40.88 
 
 		 961 aa  94.7  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.15 
 
 		 359 aa  94.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.75 
 
 		 789 aa  94  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.85 
 
 		 185 aa  93.2  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.6 
 
 		 293 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.14 
 
 		 246 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.54 
 
 		 235 aa  92.8  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.69 
 
 		 393 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.67 
 
 		 318 aa  91.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.81 
 
 		 557 aa  89.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 321 aa  89  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1877 aa  89.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.82 
 
 		 490 aa  88.6  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 303 aa  89  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 344 aa  88.6  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.64 
 
 		 489 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1402 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.38 
 
 		 267 aa  87  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  42.2 
 
 		 490 aa  87  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.64 
 
 		 256 aa  87  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 1032 aa  85.9  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.51 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.01 
 
 		 425 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.62 
 
 		 329 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 		 1430 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  36.75 
 
 		 1910 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.94 
 
 		 373 aa  84  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1493 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 231 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.77 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.53 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.75 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.55 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.86 
 
 		 464 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 225 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.53 
 
 		 685 aa  80.9  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.41 
 
 		 838 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.75 
 
 		 2413 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.84 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.6 
 
 		 255 aa  79.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.97 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.15 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.97 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.97 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.65 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.33 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 316 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  77.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.29 
 
 		 331 aa  77.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.28 
 
 		 376 aa  77  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.82 
 
 		 193 aa  76.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.57 
 
 		 267 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.34 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.56 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.92 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.29 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.12 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.03 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  29.02 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.54 
 
 		 731 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.17 
 
 		 276 aa  74.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.29 
 
 		 325 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.88 
 
 		 552 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>