More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1450 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 997 aa  1984    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 1072 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 1012 aa  139  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 1261 aa  134  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.15 
 
 		 1263 aa  115  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.28 
 
 		 1110 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  24.82 
 
 		 913 aa  108  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  45.45 
 
 		 684 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.36 
 
 		 961 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.9 
 
 		 1196 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  43.61 
 
 		 1086 aa  106  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  39.86 
 
 		 1081 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.17 
 
 		 1260 aa  105  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1275 aa  104  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  32.71 
 
 		 978 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  40.82 
 
 		 1134 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  40.69 
 
 		 1105 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.13 
 
 		 1088 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.33 
 
 		 393 aa  102  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.51 
 
 		 789 aa  102  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.57 
 
 		 528 aa  101  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1059 aa  101  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 1145 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.82 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 1226 aa  98.2  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.9 
 
 		 1110 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  49.07 
 
 		 1160 aa  96.3  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.89 
 
 		 329 aa  95.1  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  46.3 
 
 		 1105 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  43.36 
 
 		 1242 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1402 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  43.59 
 
 		 232 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  45.83 
 
 		 557 aa  91.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 		 1032 aa  91.7  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.33 
 
 		 264 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  43.2 
 
 		 274 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  43.09 
 
 		 1493 aa  90.1  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  45.53 
 
 		 255 aa  90.1  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.24 
 
 		 318 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.16 
 
 		 489 aa  89.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  41.86 
 
 		 246 aa  89  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.8 
 
 		 341 aa  89  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  44.64 
 
 		 490 aa  89  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.82 
 
 		 1199 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.59 
 
 		 2413 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35 
 
 		 1037 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.44 
 
 		 731 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  43.75 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  39.16 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.42 
 
 		 342 aa  84  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.1 
 
 		 185 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.86 
 
 		 245 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 303 aa  83.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.6 
 
 		 193 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.11 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.97 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  82.8  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  39.66 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 252 aa  82.8  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 1430 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  45 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.42 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.89 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.55 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.42 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.11 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  43.4 
 
 		 117 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.2 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  38.69 
 
 		 1475 aa  81.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  41.06 
 
 		 1877 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  80.5  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.78 
 
 		 373 aa  80.5  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  37.2 
 
 		 365 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.91 
 
 		 346 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.84 
 
 		 343 aa  80.5  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.57 
 
 		 254 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1002 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.14 
 
 		 211 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  43 
 
 		 115 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.06 
 
 		 223 aa  79.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.11 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  39.13 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  37.1 
 
 		 380 aa  77  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  34.22 
 
 		 294 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.73 
 
 		 482 aa  77  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.22 
 
 		 294 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.51 
 
 		 271 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.56 
 
 		 884 aa  76.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 233 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 181 aa  76.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.77 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  44.17 
 
 		 1003 aa  75.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.44 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.15 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>