More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0117 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.3 
 
 		 831 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.85 
 
 		 684 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1493 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.58 
 
 		 425 aa  143  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.24 
 
 		 789 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.65 
 
 		 557 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.81 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.71 
 
 		 489 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.1 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.92 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.1 
 
 		 490 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1402 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.82 
 
 		 509 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 509 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.15 
 
 		 961 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.58 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.4 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.21 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.21 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.22 
 
 		 380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 		 685 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1037 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 448 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.99 
 
 		 528 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.85 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.5 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.87 
 
 		 838 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.85 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.25 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34.01 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.67 
 
 		 2413 aa  112  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.98 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.34 
 
 		 552 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.43 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  29.56 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.5 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.11 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.01 
 
 		 376 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.78 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.54 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  50 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  41.43 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.62 
 
 		 329 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1002 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.27 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  45.6 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  49.57 
 
 		 117 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.63 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1032 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.97 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 505 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  43.33 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  31.54 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  46.28 
 
 		 185 aa  99.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 976 aa  99.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1877 aa  99.4  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  41.35 
 
 		 482 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  28.94 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.96 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.16 
 
 		 232 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.05 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.27 
 
 		 464 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 		 1430 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.95 
 
 		 512 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 181 aa  95.5  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  44.07 
 
 		 193 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  48.57 
 
 		 115 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.8 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  46.79 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  51.76 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 487 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.28 
 
 		 358 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40.94 
 
 		 221 aa  92.4  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  31.72 
 
 		 839 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.66 
 
 		 211 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  44.95 
 
 		 731 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.36 
 
 		 680 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.29 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  46.36 
 
 		 763 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.82 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.67 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  29.1 
 
 		 850 aa  88.6  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.89 
 
 		 865 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.99 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  27.67 
 
 		 523 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>