More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0801 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  58.24 
 
 		 1059 aa  1022    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  78.48 
 
 		 1105 aa  1553    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  63.34 
 
 		 1105 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  100 
 
 		 1134 aa  2234    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  59.21 
 
 		 1086 aa  1099    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  71.58 
 
 		 1110 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  55.83 
 
 		 1160 aa  1046    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  31.26 
 
 		 978 aa  256  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.25 
 
 		 1263 aa  226  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.67 
 
 		 1260 aa  224  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.78 
 
 		 1196 aa  218  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 1081 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.89 
 
 		 1261 aa  196  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.12 
 
 		 1088 aa  188  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  49.02 
 
 		 1242 aa  188  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.47 
 
 		 1110 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.18 
 
 		 1226 aa  186  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1275 aa  180  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.26 
 
 		 1012 aa  176  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  48.02 
 
 		 795 aa  168  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  36.59 
 
 		 1003 aa  155  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  27.17 
 
 		 913 aa  152  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.25 
 
 		 884 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.79 
 
 		 318 aa  129  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.4 
 
 		 305 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.03 
 
 		 831 aa  124  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.77 
 
 		 1037 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.26 
 
 		 684 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1493 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 1072 aa  121  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.17 
 
 		 393 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.21 
 
 		 528 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.31 
 
 		 1402 aa  118  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.98 
 
 		 235 aa  117  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  41.29 
 
 		 2413 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  40.26 
 
 		 557 aa  116  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 		 416 aa  115  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  39.61 
 
 		 789 aa  114  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.16 
 
 		 241 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.74 
 
 		 961 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.23 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.13 
 
 		 376 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.11 
 
 		 489 aa  111  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.13 
 
 		 376 aa  110  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1877 aa  109  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 303 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.18 
 
 		 256 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  38.86 
 
 		 1910 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.89 
 
 		 373 aa  108  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  107  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 425 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 1032 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 252 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.77 
 
 		 232 aa  105  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1002 aa  105  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.46 
 
 		 490 aa  105  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.29 
 
 		 685 aa  104  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.42 
 
 		 271 aa  104  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 997 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 448 aa  103  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.46 
 
 		 490 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.95 
 
 		 343 aa  103  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.12 
 
 		 329 aa  102  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.66 
 
 		 208 aa  103  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 		 321 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.01 
 
 		 552 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 193 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.76 
 
 		 293 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.71 
 
 		 341 aa  100  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  100  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.42 
 
 		 838 aa  99.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.97 
 
 		 267 aa  99.8  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.33 
 
 		 763 aa  99  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.47 
 
 		 264 aa  99  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.09 
 
 		 342 aa  98.2  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 325 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 325 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  35.76 
 
 		 303 aa  97.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.62 
 
 		 392 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.77 
 
 		 245 aa  95.9  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 		 254 aa  95.9  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 		 746 aa  95.5  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 276 aa  95.1  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 231 aa  95.1  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.94 
 
 		 222 aa  94.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 278 aa  94.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 976 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.11 
 
 		 331 aa  94.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 274 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 261 aa  93.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1141 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 181 aa  93.6  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.09 
 
 		 285 aa  94  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 255 aa  93.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.18 
 
 		 331 aa  92.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.95 
 
 		 316 aa  92  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.59 
 
 		 331 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.59 
 
 		 331 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.21 
 
 		 380 aa  91.7  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.71 
 
 		 380 aa  91.3  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>