More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1095 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 1003 aa  2015    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  42.76 
 
 		 1081 aa  195  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  50 
 
 		 978 aa  193  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  55.56 
 
 		 1088 aa  191  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  51.5 
 
 		 1242 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.03 
 
 		 1196 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.02 
 
 		 1110 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  44.36 
 
 		 1145 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 1263 aa  186  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.58 
 
 		 1110 aa  184  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  44.72 
 
 		 1086 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 1261 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  46.84 
 
 		 1059 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 1260 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  42.5 
 
 		 1134 aa  172  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  43.72 
 
 		 1105 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.5 
 
 		 1012 aa  162  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.28 
 
 		 1226 aa  161  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  48.13 
 
 		 1275 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  44.55 
 
 		 1105 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.74 
 
 		 1199 aa  158  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1160 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.64 
 
 		 884 aa  154  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  47.2 
 
 		 913 aa  150  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.76 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 		 831 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.4 
 
 		 684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.12 
 
 		 318 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.27 
 
 		 1072 aa  115  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.28 
 
 		 961 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  40.36 
 
 		 416 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1037 aa  109  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  42.58 
 
 		 557 aa  108  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.51 
 
 		 489 aa  107  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.81 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.42 
 
 		 235 aa  106  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.07 
 
 		 490 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.35 
 
 		 1402 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.22 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.71 
 
 		 393 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 252 aa  102  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1877 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.81 
 
 		 241 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  33.71 
 
 		 1910 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 303 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.22 
 
 		 2413 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.12 
 
 		 838 aa  99  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.08 
 
 		 267 aa  99  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.87 
 
 		 346 aa  99  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1493 aa  97.8  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 448 aa  97.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 		 528 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40.28 
 
 		 221 aa  96.3  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.72 
 
 		 685 aa  96.3  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.71 
 
 		 305 aa  95.9  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 		 1032 aa  95.5  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 1430 aa  95.1  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  39.46 
 
 		 271 aa  94.7  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.51 
 
 		 997 aa  94  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.18 
 
 		 218 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.76 
 
 		 232 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 380 aa  92.8  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.97 
 
 		 185 aa  92.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 380 aa  91.3  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.77 
 
 		 329 aa  90.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.95 
 
 		 276 aa  89.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.34 
 
 		 208 aa  89  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38.36 
 
 		 358 aa  89  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  28.77 
 
 		 344 aa  88.2  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 325 aa  88.2  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 325 aa  88.2  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.38 
 
 		 255 aa  87.8  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.29 
 
 		 376 aa  87.4  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.9 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.29 
 
 		 376 aa  87  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.13 
 
 		 193 aa  87  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36.76 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.15 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.31 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 181 aa  85.1  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.76 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  34.93 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.52 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.16 
 
 		 285 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.81 
 
 		 274 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.47 
 
 		 293 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.25 
 
 		 315 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  35.8 
 
 		 325 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.54 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 343 aa  83.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.49 
 
 		 231 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.14 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 890 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.19 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36.77 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>