More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1532 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
746 aa  1511    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  38.24 
 
 
1493 aa  124  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 
685 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.92 
 
 
831 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.59 
 
 
684 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.5 
 
 
318 aa  120  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.57 
 
 
376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.96 
 
 
961 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.43 
 
 
1402 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.57 
 
 
376 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.07 
 
 
489 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.04 
 
 
1037 aa  117  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.07 
 
 
1877 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.35 
 
 
838 aa  114  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
789 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  43.26 
 
 
763 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.65 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.43 
 
 
425 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.74 
 
 
305 aa  111  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.91 
 
 
218 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.3 
 
 
393 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.76 
 
 
557 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.81 
 
 
274 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.67 
 
 
416 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  41.01 
 
 
267 aa  104  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.64 
 
 
2413 aa  103  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.34 
 
 
552 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.96 
 
 
329 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.36 
 
 
343 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.49 
 
 
208 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.25 
 
 
264 aa  101  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.17 
 
 
331 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.17 
 
 
331 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
252 aa  100  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.43 
 
 
245 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.33 
 
 
331 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.41 
 
 
380 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.36 
 
 
241 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.41 
 
 
193 aa  99.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
1430 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
448 aa  98.6  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.42 
 
 
380 aa  98.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.47 
 
 
509 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.73 
 
 
1002 aa  97.4  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.47 
 
 
509 aa  97.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 
278 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.96 
 
 
235 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.76 
 
 
490 aa  96.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 
528 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.86 
 
 
346 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
1110 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.16 
 
 
509 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.76 
 
 
490 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.95 
 
 
523 aa  96.3  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.47 
 
 
509 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.43 
 
 
850 aa  95.5  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.51 
 
 
271 aa  95.5  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.17 
 
 
293 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 
865 aa  94.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.64 
 
 
331 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.74 
 
 
325 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 
231 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.74 
 
 
325 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 
341 aa  94  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.06 
 
 
285 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.29 
 
 
342 aa  93.6  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.21 
 
 
327 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  28.98 
 
 
1160 aa  93.2  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.68 
 
 
359 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.21 
 
 
325 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 
976 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34 
 
 
1012 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.84 
 
 
731 aa  92  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  39.16 
 
 
839 aa  91.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.18 
 
 
482 aa  92  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
1032 aa  91.3  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 
720 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.51 
 
 
246 aa  91.3  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.93 
 
 
680 aa  90.5  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  32.93 
 
 
720 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.67 
 
 
185 aa  90.1  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  32.93 
 
 
720 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  32.69 
 
 
1086 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.84 
 
 
315 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
223 aa  90.1  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.3 
 
 
255 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40.17 
 
 
1910 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.09 
 
 
255 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.6 
 
 
254 aa  89.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  39.13 
 
 
399 aa  89  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.97 
 
 
373 aa  89  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.28 
 
 
1059 aa  88.6  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.92 
 
 
270 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
303 aa  87.8  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  32.05 
 
 
1105 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.16 
 
 
307 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.08 
 
 
679 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.43 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.16 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.76 
 
 
225 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>