280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1685 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  61.79 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  47.83 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.49 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  48.73 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.66 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  46.64 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.66 
 
 		 295 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  45.66 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.63 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  52.34 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  43.84 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  50.46 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  52.66 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  49.08 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  46.33 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  38.4 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  39.57 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  39.57 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  37.77 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.33 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  39.29 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1402 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.21 
 
 		 961 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.57 
 
 		 684 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1037 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.69 
 
 		 2413 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.5 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.65 
 
 		 489 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.46 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.09 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.65 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 831 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.88 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.71 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.95 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.58 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.35 
 
 		 789 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.58 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.03 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.36 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.67 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.1 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  29 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.3 
 
 		 838 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.15 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  29.21 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  29.53 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.82 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.71 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.51 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.86 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.47 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.71 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.48 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.58 
 
 		 971 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 971 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  28.71 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  35.51 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.73 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0477  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.535577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1032 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  36.51 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.44 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.77 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 448 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.78 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.65 
 
 		 172 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1877 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 565 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.08 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.42 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 693 aa  52.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  27.27 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.29 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.05 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  29.82 
 
 		 185 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.21 
 
 		 890 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  37.72 
 
 		 181 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.72 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>