More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3872 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  534  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  78.99 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  64.73 
 
 		 259 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  64.73 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  64.73 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  64.73 
 
 		 259 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  61.63 
 
 		 259 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  63.18 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  62.02 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  62.02 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  62.02 
 
 		 259 aa  347  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  68.8 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  61.87 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  60.47 
 
 		 259 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  58.14 
 
 		 265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  56.98 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.23 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.69 
 
 		 684 aa  85.9  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.17 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.29 
 
 		 961 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.42 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 557 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 831 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1493 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.87 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.29 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.17 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.61 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.71 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.8 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.54 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1402 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.98 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.57 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.56 
 
 		 838 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.42 
 
 		 528 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.6 
 
 		 325 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.6 
 
 		 325 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.6 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.74 
 
 		 331 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 976 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.57 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.45 
 
 		 2413 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.82 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1037 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.89 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.48 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.68 
 
 		 731 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  39.47 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  36.8 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.62 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.72 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.16 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.04 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.25 
 
 		 1002 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.48 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.39 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.16 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  41.05 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.88 
 
 		 839 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  39.56 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.13 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1877 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.8 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  32.46 
 
 		 765 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.37 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 1196 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  34 
 
 		 978 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.29 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  31.3 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  37.23 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.92 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.96 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 1261 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  28.91 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  38.04 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 1430 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.61 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.95 
 
 		 1263 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.67 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.51 
 
 		 679 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.86 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.17 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  34.21 
 
 		 720 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  34.21 
 
 		 720 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>