More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1970 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 132 aa  266  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  55.13 
 
 		 789 aa  95.1  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  48.04 
 
 		 425 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  42.4 
 
 		 271 aa  93.6  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.32 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  47.12 
 
 		 1402 aa  89.4  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 		 341 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 528 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  46.59 
 
 		 831 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  48.35 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  47.62 
 
 		 489 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.81 
 
 		 1344 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.27 
 
 		 684 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  51.32 
 
 		 961 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  42.55 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  51.9 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  47.73 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  45.16 
 
 		 2413 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  45.16 
 
 		 393 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  49.35 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.8 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1493 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  44.83 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  43.02 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.05 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.32 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  43.82 
 
 		 1002 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  46.43 
 
 		 416 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 255 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.78 
 
 		 376 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  45.16 
 
 		 256 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  44.83 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  41.11 
 
 		 264 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  45.05 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  48.68 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.05 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  39.58 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  42.7 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  45.88 
 
 		 552 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  41.94 
 
 		 482 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  46.99 
 
 		 586 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  43.02 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  39.78 
 
 		 839 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.38 
 
 		 305 aa  74.3  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  43.9 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  41.05 
 
 		 763 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  43.82 
 
 		 1796 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.25 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.94 
 
 		 255 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.56 
 
 		 278 aa  73.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  43.33 
 
 		 490 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  46.75 
 
 		 208 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  46.25 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  46.25 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  46.25 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  43.33 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  40.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  40.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  46.84 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  45.78 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  40.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  43.68 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.83 
 
 		 343 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  46.15 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  45.57 
 
 		 1877 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.7 
 
 		 1196 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  47.06 
 
 		 850 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1037 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  43.01 
 
 		 685 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.59 
 
 		 346 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.16 
 
 		 1012 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  46.34 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.37 
 
 		 245 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.35 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.53 
 
 		 1261 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 260 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  41.38 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.65 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  41.11 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  47.67 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  38.37 
 
 		 978 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.87 
 
 		 1263 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  40.4 
 
 		 942 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  34.38 
 
 		 913 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  43.18 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  43.84 
 
 		 1059 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  45.24 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  35.63 
 
 		 1086 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  42.53 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.47 
 
 		 1110 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  33.06 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>