More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2074 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
295 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  29.73 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  40.71 
 
 
241 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  39.83 
 
 
155 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40.34 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  42.06 
 
 
165 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
448 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.82 
 
 
1402 aa  86.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.61 
 
 
1196 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 
1261 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.75 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  40.43 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  35.54 
 
 
913 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.59 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  37.5 
 
 
978 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.94 
 
 
1263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.3 
 
 
552 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 
1012 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  32.8 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.13 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.73 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  38.68 
 
 
1059 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.73 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  37.14 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.01 
 
 
961 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.9 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.71 
 
 
1110 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.63 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.84 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  36.79 
 
 
1086 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.61 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.88 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  35.24 
 
 
184 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  43.01 
 
 
185 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.45 
 
 
1493 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.68 
 
 
132 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  32.56 
 
 
509 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.56 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  32.56 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
1877 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  42.7 
 
 
1037 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  35.24 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  46.43 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  35.24 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  35.4 
 
 
1796 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1358  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.33 
 
 
831 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.4 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  40.91 
 
 
1081 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  46.07 
 
 
1281 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.08 
 
 
2413 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  35.51 
 
 
795 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  40.45 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  46.43 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  41.38 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.57 
 
 
684 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.84 
 
 
1260 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  46.43 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  46.43 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  46.43 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.57 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.1 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.24 
 
 
184 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.24 
 
 
1110 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  33.02 
 
 
1105 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  33.02 
 
 
1134 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.53 
 
 
1088 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.3 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  42.7 
 
 
557 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.22 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  29.24 
 
 
1145 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  43.33 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.8 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 
865 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  47.62 
 
 
817 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.2 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.21 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  47.37 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.33 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  40.45 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.2 
 
 
490 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  32.96 
 
 
839 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  35.77 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  36.64 
 
 
850 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.66 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  35.4 
 
 
1160 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.2 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  45.24 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.45 
 
 
1002 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  43.75 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>