More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  69.66 
 
 
182 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  67.42 
 
 
182 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  68.75 
 
 
184 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  69.81 
 
 
182 aa  233  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  69.66 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  70 
 
 
182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  67.92 
 
 
181 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  69.18 
 
 
181 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.92 
 
 
181 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  67.92 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.72 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  32.8 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.74 
 
 
490 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.2 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.84 
 
 
490 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.17 
 
 
789 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.7 
 
 
1344 aa  68.2  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.23 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  34.45 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  47.62 
 
 
1877 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
557 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 
393 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  41.57 
 
 
765 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  31.01 
 
 
328 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.11 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  38.46 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  34.34 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.25 
 
 
2413 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.8 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.27 
 
 
1263 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.54 
 
 
1199 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  33.88 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  40.23 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.82 
 
 
552 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 
489 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.97 
 
 
961 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 
1110 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.04 
 
 
341 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  64.3  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  35.64 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.78 
 
 
231 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.09 
 
 
380 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
448 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.45 
 
 
1012 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  36.94 
 
 
416 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.35 
 
 
684 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.65 
 
 
1059 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.35 
 
 
731 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.56 
 
 
1402 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.26 
 
 
245 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  35.05 
 
 
399 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 
1196 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  29.32 
 
 
233 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.29 
 
 
1002 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.46 
 
 
1261 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.22 
 
 
425 aa  62  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  30.23 
 
 
329 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.05 
 
 
347 aa  62.4  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.91 
 
 
256 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.68 
 
 
1086 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.83 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  38.16 
 
 
850 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 
255 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.05 
 
 
278 aa  61.2  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2820  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.9 
 
 
202 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.28 
 
 
346 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.93 
 
 
373 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 
318 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.69 
 
 
373 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  31.68 
 
 
1134 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  45.83 
 
 
647 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 
255 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 
343 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  41.03 
 
 
269 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.68 
 
 
1105 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 
1226 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  25.75 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
831 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.14 
 
 
376 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  32.65 
 
 
722 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  32.65 
 
 
722 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  34.07 
 
 
265 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  27.83 
 
 
293 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
260 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
1430 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  39.51 
 
 
368 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.73 
 
 
565 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
976 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  34.94 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  34.94 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>