More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1424 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 357 aa  714    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  43.53 
 
 		 978 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  43.48 
 
 		 185 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.79 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  45.12 
 
 		 789 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1059 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  42.7 
 
 		 684 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.01 
 
 		 523 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  42.35 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.85 
 
 		 961 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.05 
 
 		 126 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 1261 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  36.96 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1877 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 1196 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1402 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  32.5 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.52 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  44.32 
 
 		 117 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.89 
 
 		 232 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  42 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.18 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  43.37 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 1226 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 1012 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1160 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.86 
 
 		 1260 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.46 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  38.33 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.48 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  43.42 
 
 		 1037 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.04 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.27 
 
 		 490 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.86 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.54 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  43.9 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  48.68 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.71 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.05 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1493 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.16 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  32.54 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.24 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.98 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1002 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 831 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  42.86 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.11 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.46 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  36.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  40.79 
 
 		 1134 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  31.37 
 
 		 942 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  40.79 
 
 		 1105 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  42.11 
 
 		 1086 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  44.71 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0100  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.9 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.334736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1281 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  40.26 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  40 
 
 		 1105 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.49 
 
 		 132 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  40.91 
 
 		 137 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.45 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1344 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.08 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  36.79 
 
 		 182 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.92 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  42.39 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.04 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.51 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  36.96 
 
 		 765 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.24 
 
 		 2413 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.56 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.1 
 
 		 838 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.02 
 
 		 1110 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  28.93 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  35.85 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  37.8 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.63 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.08 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 1430 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  41.46 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>