More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0191 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  55.27 
 
 
820 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
1344 aa  2766    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  38.86 
 
 
828 aa  453  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  37.48 
 
 
832 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  37.27 
 
 
954 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  37.5 
 
 
866 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  31.75 
 
 
845 aa  363  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  32.33 
 
 
798 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  32.56 
 
 
812 aa  358  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  28.85 
 
 
782 aa  318  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  29.51 
 
 
728 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  28.51 
 
 
797 aa  297  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  30.23 
 
 
798 aa  290  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  30.08 
 
 
777 aa  290  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  27.71 
 
 
1123 aa  287  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  30.08 
 
 
798 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  28.73 
 
 
747 aa  279  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  27.32 
 
 
750 aa  278  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  34.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  29.43 
 
 
867 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  26.48 
 
 
735 aa  204  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  26.38 
 
 
726 aa  159  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  29.2 
 
 
1356 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  39.5 
 
 
425 aa  95.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.41 
 
 
271 aa  90.9  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  43.33 
 
 
303 aa  89.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  37.98 
 
 
482 aa  88.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  35.78 
 
 
304 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 
172 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  36.15 
 
 
839 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.13 
 
 
2413 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.21 
 
 
232 aa  84.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.81 
 
 
132 aa  84  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  47.13 
 
 
185 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.5 
 
 
241 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  44.23 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  80.9  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  22.26 
 
 
489 aa  81.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.22 
 
 
126 aa  80.9  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.08 
 
 
731 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.61 
 
 
341 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.61 
 
 
246 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.36 
 
 
305 aa  80.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.68 
 
 
393 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.06 
 
 
961 aa  80.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 
343 aa  79.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  40.37 
 
 
256 aa  79.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  41.38 
 
 
1877 aa  79  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  36.25 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 
274 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.68 
 
 
255 aa  77  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.34 
 
 
318 aa  76.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.96 
 
 
163 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  43.16 
 
 
789 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  49.37 
 
 
850 aa  76.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.93 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.85 
 
 
1402 aa  75.1  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.13 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.91 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.11 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  45.12 
 
 
254 aa  74.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.18 
 
 
255 aa  74.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
448 aa  73.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
344 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  43.48 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  40.43 
 
 
202 aa  72.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  42.86 
 
 
684 aa  72  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.22 
 
 
1493 aa  72  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  38.3 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.37 
 
 
685 aa  71.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.83 
 
 
346 aa  71.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
380 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.25 
 
 
264 aa  71.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 
252 aa  71.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.53 
 
 
181 aa  70.1  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.04 
 
 
208 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  39.13 
 
 
294 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  39.13 
 
 
294 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  40.22 
 
 
322 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  40.91 
 
 
260 aa  70.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.96 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  38.71 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.76 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  40.7 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.79 
 
 
267 aa  68.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
222 aa  68.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.4 
 
 
838 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.76 
 
 
376 aa  68.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  42.53 
 
 
490 aa  67.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  38.54 
 
 
294 aa  67.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.54 
 
 
294 aa  67.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 
416 aa  68.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  36.27 
 
 
137 aa  68.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  37.93 
 
 
249 aa  67  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>