More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  96.7 
 
 
182 aa  330  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  73.63 
 
 
182 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  74.18 
 
 
182 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  75.54 
 
 
184 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  70.88 
 
 
182 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  67.42 
 
 
181 aa  241  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  73.77 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  71.58 
 
 
181 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  71.58 
 
 
181 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  71.58 
 
 
181 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.59 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.05 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  35.24 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.48 
 
 
489 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.5 
 
 
490 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 
254 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.15 
 
 
373 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.15 
 
 
373 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  41.05 
 
 
1877 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  42.11 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.95 
 
 
789 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  42.17 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.74 
 
 
961 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.54 
 
 
490 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.64 
 
 
2413 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.46 
 
 
684 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.55 
 
 
1012 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 
831 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  36.61 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.17 
 
 
1344 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.48 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.95 
 
 
1402 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.26 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.63 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  40.38 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  40.38 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.64 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.84 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  34.4 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.67 
 
 
344 aa  64.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.36 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  37.93 
 
 
850 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.16 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 
303 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  30.08 
 
 
765 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
303 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 
425 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  39.42 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 
248 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 
343 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  41.67 
 
 
329 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  39.42 
 
 
258 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  39.42 
 
 
258 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  37.04 
 
 
249 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  37.36 
 
 
258 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.42 
 
 
865 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  39.42 
 
 
258 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.18 
 
 
557 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  39.42 
 
 
258 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  43.84 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  40.24 
 
 
328 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 
380 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  34.38 
 
 
722 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  37.36 
 
 
257 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.83 
 
 
1263 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  34.38 
 
 
722 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 
347 aa  62  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.56 
 
 
255 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  34.38 
 
 
722 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  43.24 
 
 
380 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.78 
 
 
1037 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  34.07 
 
 
233 aa  61.6  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.25 
 
 
232 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  38.04 
 
 
647 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 
132 aa  60.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 
523 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
357 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  33.33 
 
 
971 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 
276 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  36.08 
 
 
155 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31.78 
 
 
260 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 
270 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 
250 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.58 
 
 
341 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.67 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  35.16 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.48 
 
 
838 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>