More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0907 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  52.27 
 
 		 165 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  52.27 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  45.83 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0743  Sel1-like  44.88 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.26 
 
 		 235 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 448 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  42.72 
 
 		 1493 aa  85.5  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  40.91 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  40.65 
 
 		 489 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.88 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  39.64 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.93 
 
 		 961 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  49.43 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.05 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1037 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  46.25 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.33 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 831 aa  74.7  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 255 aa  74.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  41.07 
 
 		 256 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.44 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.98 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.94 
 
 		 2413 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.46 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  42.24 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1877 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.21 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  44.3 
 
 		 254 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.62 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.82 
 
 		 789 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 359 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.53 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  43.75 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.17 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.75 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.83 
 
 		 552 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  45.12 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  40.7 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  45.88 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  44.71 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  40.91 
 
 		 839 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.41 
 
 		 329 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.21 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  41.03 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.29 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  35.38 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.63 
 
 		 731 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.48 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  33.8 
 
 		 765 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.28 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.38 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.83 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.38 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  41.67 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1344 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.81 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1402 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1002 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  36.79 
 
 		 795 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.33 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.67 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  47.95 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 1196 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.67 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.1 
 
 		 838 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.09 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.3 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  39.78 
 
 		 342 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  40.48 
 
 		 415 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  43.06 
 
 		 978 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.46 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  30.6 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.51 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40.51 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>