More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3776 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  72.53 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  70.88 
 
 		 182 aa  277  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  71.43 
 
 		 182 aa  260  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  71.43 
 
 		 182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  67.98 
 
 		 181 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  67.93 
 
 		 184 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  71.04 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  68.31 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  68.31 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  68.31 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  44.44 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  40.62 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 1012 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 		 789 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  43.21 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.43 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.04 
 
 		 961 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.64 
 
 		 489 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.01 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  38.04 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.14 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.17 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 448 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.08 
 
 		 2413 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.97 
 
 		 438 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 318 aa  64.3  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.42 
 
 		 684 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  31.43 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 831 aa  64.3  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.77 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.77 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.13 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  41 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  34.21 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  33.03 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.03 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1402 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.15 
 
 		 552 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  62  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  37.36 
 
 		 331 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  37.93 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  37.36 
 
 		 331 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.66 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  36.59 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  37.8 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.2 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1002 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.89 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 731 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 765 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  32 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 1475 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  33.67 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1493 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1344 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 		 865 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  36.07 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  35 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 357 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.02 
 
 		 679 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.57 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.84 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  28.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32 
 
 		 971 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.02 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  41.67 
 
 		 850 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2820  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.74 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.41 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1877 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1037 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 1430 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>