More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0176 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  99.61 
 
 
258 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  98.84 
 
 
258 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  98.84 
 
 
258 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  98.84 
 
 
258 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  98.84 
 
 
258 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  98.84 
 
 
258 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  86.61 
 
 
255 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  75.65 
 
 
250 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  75.65 
 
 
250 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  79.71 
 
 
250 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  76.06 
 
 
258 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  78.87 
 
 
257 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  70.87 
 
 
258 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  70.87 
 
 
260 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  69.19 
 
 
236 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  69.86 
 
 
233 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.58 
 
 
234 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.37 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.13 
 
 
248 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  49.77 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  46.05 
 
 
252 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  46.43 
 
 
249 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 
831 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.48 
 
 
961 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  38.67 
 
 
254 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35 
 
 
684 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.48 
 
 
1402 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40.25 
 
 
1032 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.9 
 
 
1037 aa  99.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
318 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.48 
 
 
393 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.72 
 
 
1012 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.76 
 
 
789 aa  96.3  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.88 
 
 
185 aa  95.9  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.91 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.16 
 
 
2413 aa  92.8  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.24 
 
 
489 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.58 
 
 
557 aa  92  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.34 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.29 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.73 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.92 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.13 
 
 
1002 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.91 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.58 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.67 
 
 
1493 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.06 
 
 
490 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.25 
 
 
172 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.07 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.68 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.73 
 
 
232 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
976 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.06 
 
 
490 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.78 
 
 
373 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.94 
 
 
211 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  39.85 
 
 
591 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.09 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  35.26 
 
 
1141 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.28 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.35 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  32.21 
 
 
1078 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.15 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.95 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  32.21 
 
 
1044 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
448 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.86 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.05 
 
 
380 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.22 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.99 
 
 
685 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.62 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.48 
 
 
838 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.52 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.99 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.2 
 
 
731 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.72 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.46 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  29.24 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.9 
 
 
1110 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.12 
 
 
865 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.11 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.65 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.1 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.53 
 
 
523 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.53 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.89 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.68 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  33.85 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.1 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.15 
 
 
1059 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.33 
 
 
528 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  36.47 
 
 
978 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>