More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4087 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  45 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 528 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  44.44 
 
 		 684 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  48.65 
 
 		 789 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  47.37 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  46.05 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  46.05 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40.22 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  47.83 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.36 
 
 		 961 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.29 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.5 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.4 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  44.93 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.33 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.59 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  37.61 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1402 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.48 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  42.31 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.68 
 
 		 838 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.65 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.18 
 
 		 2413 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.25 
 
 		 865 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  41.46 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  41.03 
 
 		 1037 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.96 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  42.47 
 
 		 1796 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.46 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  43.53 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  39 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.77 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.48 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 		 831 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  43.59 
 
 		 971 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.59 
 
 		 971 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  35.42 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  37.65 
 
 		 795 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.74 
 
 		 1012 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.19 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  44.29 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  38.1 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  36.9 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.55 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  42.31 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.9 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  41.1 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  42.03 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1493 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  45.71 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  36.59 
 
 		 1078 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  43.42 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  36.59 
 
 		 1044 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  47.89 
 
 		 839 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  39.44 
 
 		 1086 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 1260 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1877 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.79 
 
 		 1196 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 		 1032 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  43.24 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  39.44 
 
 		 1059 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 1261 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  35.9 
 
 		 1200 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  35.44 
 
 		 1200 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  38.57 
 
 		 763 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  34 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.35 
 
 		 1263 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  50.79 
 
 		 137 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 		 890 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 505 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.71 
 
 		 1110 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  39.47 
 
 		 913 aa  61.6  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  41.89 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  43.48 
 
 		 685 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.05 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1160 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  39.47 
 
 		 978 aa  61.6  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  33.65 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  37.68 
 
 		 380 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.07 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.97 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  39.44 
 
 		 1105 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  32.38 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 976 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>