More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  91.79 
 
 
329 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 
789 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.1 
 
 
2413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.73 
 
 
1402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  40.95 
 
 
557 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 
393 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
831 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.57 
 
 
341 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.44 
 
 
684 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.35 
 
 
318 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.69 
 
 
1493 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.94 
 
 
264 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.91 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.95 
 
 
416 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.71 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.94 
 
 
489 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.04 
 
 
425 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40.88 
 
 
961 aa  112  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.86 
 
 
528 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 
1037 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 
448 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.46 
 
 
376 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.47 
 
 
342 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.62 
 
 
1002 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
252 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.13 
 
 
685 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.32 
 
 
490 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.24 
 
 
274 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.12 
 
 
278 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.32 
 
 
490 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.08 
 
 
376 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.7 
 
 
235 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.38 
 
 
305 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.25 
 
 
255 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.12 
 
 
343 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.24 
 
 
271 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.54 
 
 
241 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.65 
 
 
232 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40.15 
 
 
221 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.48 
 
 
838 aa  102  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.23 
 
 
464 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 
316 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 
346 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
1877 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
976 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.54 
 
 
303 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.83 
 
 
208 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.8 
 
 
373 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.25 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 
392 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35.4 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.72 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.23 
 
 
373 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 
222 aa  95.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.02 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  39.27 
 
 
325 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 
172 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 
223 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.27 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
1032 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  39.27 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.33 
 
 
731 aa  90.5  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  29.86 
 
 
1141 aa  90.1  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  38.62 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36.56 
 
 
552 aa  89.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.2 
 
 
272 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.86 
 
 
245 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.53 
 
 
850 aa  88.6  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  34.9 
 
 
410 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.15 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.64 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.06 
 
 
763 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 
523 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.15 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  38.74 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.8 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.15 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.15 
 
 
321 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.91 
 
 
331 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  43.02 
 
 
301 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  33.15 
 
 
365 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  34.68 
 
 
509 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  34.68 
 
 
509 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  34.68 
 
 
509 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  34.68 
 
 
509 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  36.96 
 
 
505 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.41 
 
 
679 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.79 
 
 
315 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  34.78 
 
 
720 aa  85.9  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  34.78 
 
 
720 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  31.28 
 
 
839 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 
720 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  38.22 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.53 
 
 
193 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  40.16 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  31.86 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.16 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>