More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0225 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
347 aa  709    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.63 
 
 
684 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.31 
 
 
961 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.28 
 
 
789 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.43 
 
 
489 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.51 
 
 
425 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.91 
 
 
1402 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.53 
 
 
831 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 
528 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.58 
 
 
482 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.46 
 
 
305 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.79 
 
 
392 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 
464 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.65 
 
 
271 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
254 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.46 
 
 
380 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.03 
 
 
318 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.7 
 
 
264 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.39 
 
 
376 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.18 
 
 
342 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.02 
 
 
393 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.01 
 
 
293 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.86 
 
 
838 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.71 
 
 
557 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.92 
 
 
376 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.11 
 
 
255 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.78 
 
 
341 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.68 
 
 
890 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.95 
 
 
2413 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.41 
 
 
343 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.86 
 
 
490 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.86 
 
 
490 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.2 
 
 
1877 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.65 
 
 
256 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.82 
 
 
315 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
1032 aa  99.8  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
303 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 
416 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
448 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.84 
 
 
865 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.11 
 
 
1493 aa  97.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.53 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.6 
 
 
1037 aa  97.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  35.29 
 
 
839 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.75 
 
 
971 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
252 aa  93.2  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.39 
 
 
685 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  33.66 
 
 
365 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.63 
 
 
1002 aa  92.8  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.03 
 
 
232 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.66 
 
 
680 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  33.33 
 
 
971 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 
278 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.6 
 
 
679 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.46 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
976 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.51 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.96 
 
 
185 aa  90.9  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.03 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.8 
 
 
245 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.95 
 
 
208 aa  90.1  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.62 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  29.22 
 
 
509 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  30.89 
 
 
509 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.98 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.68 
 
 
961 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.06 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 
487 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.05 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.73 
 
 
282 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.66 
 
 
319 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  26.01 
 
 
552 aa  87.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  32.5 
 
 
850 aa  86.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.64 
 
 
523 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.81 
 
 
509 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.67 
 
 
512 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.81 
 
 
509 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.5 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.79 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.92 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.14 
 
 
222 aa  84  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.67 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.3 
 
 
693 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.31 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  33.74 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.22 
 
 
1044 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.23 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.22 
 
 
1078 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.73 
 
 
731 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.47 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.64 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>