More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0312 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 322 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  65.05 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  43.29 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  45.32 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  42.57 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.62 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  44.8 
 
 		 366 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.44 
 
 		 382 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  43.17 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.06 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  44.17 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  46.37 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  41.7 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  46.74 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.83 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  37.11 
 
 		 540 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1402 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  36.18 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.91 
 
 		 831 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.84 
 
 		 684 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.93 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.94 
 
 		 961 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 789 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.29 
 
 		 489 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 528 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.48 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 557 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.55 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 1032 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 		 685 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.82 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.02 
 
 		 373 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.44 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1037 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.56 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  33 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  35.68 
 
 		 482 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.74 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  33 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.66 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.93 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1493 aa  113  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.85 
 
 		 2413 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.02 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35 
 
 		 1002 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  36.86 
 
 		 971 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.41 
 
 		 256 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.44 
 
 		 971 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.11 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.84 
 
 		 838 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.17 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.41 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.52 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 464 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.14 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  38.94 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.67 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  33.21 
 
 		 591 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 976 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32.7 
 
 		 505 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1877 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.02 
 
 		 679 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.07 
 
 		 208 aa  99.8  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.13 
 
 		 267 aa  99.8  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.53 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.42 
 
 		 329 aa  99  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.2 
 
 		 680 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  38.31 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  32.66 
 
 		 478 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.8 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.16 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.47 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.97 
 
 		 241 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.67 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.16 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.16 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.78 
 
 		 512 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.48 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.73 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.18 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.7 
 
 		 185 aa  93.6  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>