More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3011 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  58.87 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  58.02 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0743  Sel1-like  57.14 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  55.4 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.27 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  41.51 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  42.06 
 
 		 295 aa  90.9  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  41.82 
 
 		 241 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.78 
 
 		 222 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 448 aa  84  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  44.57 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  43.75 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.75 
 
 		 528 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  46.07 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  54.79 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  34.68 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  51.85 
 
 		 489 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  52.05 
 
 		 831 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.04 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.51 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  47.19 
 
 		 425 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  43.27 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.15 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  60.27 
 
 		 346 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.93 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  46.59 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  42.86 
 
 		 438 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  44.68 
 
 		 684 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.45 
 
 		 2413 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  45.74 
 
 		 415 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  46.74 
 
 		 1402 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1037 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.27 
 
 		 789 aa  70.9  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  46.32 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  42.7 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.94 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.33 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  47.95 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  47.95 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  49.33 
 
 		 1493 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  49.33 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.6 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.58 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.47 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  43.68 
 
 		 416 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  40 
 
 		 552 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  38.71 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  42.05 
 
 		 839 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 		 1344 aa  67.4  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  40.38 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  44.32 
 
 		 1078 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  43.01 
 
 		 850 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  44.32 
 
 		 1044 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  47.95 
 
 		 961 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.64 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  35.42 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  37.72 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  46.97 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.23 
 
 		 890 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.37 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.29 
 
 		 278 aa  64.7  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.64 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.5 
 
 		 347 aa  64.7  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.85 
 
 		 450 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.86 
 
 		 293 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.08 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  44 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  37.96 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  39 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.21 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.21 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1796 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  50.72 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  39.8 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  43.84 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  35.9 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 1012 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1002 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.84 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.45 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  30.17 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  43.84 
 
 		 838 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  41.56 
 
 		 208 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 		 455 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  42.31 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  43.84 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.19 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>