More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0510 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.74 
 
 
343 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.03 
 
 
557 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 
831 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.04 
 
 
489 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.35 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.56 
 
 
684 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.44 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.68 
 
 
425 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.41 
 
 
789 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.82 
 
 
1402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.39 
 
 
961 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.75 
 
 
341 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
252 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.12 
 
 
1493 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.38 
 
 
490 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.95 
 
 
490 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.52 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.84 
 
 
373 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.45 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.23 
 
 
685 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.52 
 
 
222 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.22 
 
 
255 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.58 
 
 
376 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.58 
 
 
376 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.35 
 
 
373 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.96 
 
 
505 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
448 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.19 
 
 
256 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.01 
 
 
278 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.62 
 
 
264 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.67 
 
 
393 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.32 
 
 
232 aa  99  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.3 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.42 
 
 
218 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.78 
 
 
865 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.8 
 
 
2413 aa  96.3  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  96.3  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.48 
 
 
838 aa  95.9  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
223 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 
380 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 
528 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.12 
 
 
392 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.83 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.58 
 
 
208 aa  93.2  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  29.67 
 
 
850 aa  92.8  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.7 
 
 
1037 aa  93.2  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.53 
 
 
321 aa  92.4  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.31 
 
 
416 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.83 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.53 
 
 
365 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 
1002 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  32.32 
 
 
839 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.5 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.5 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.48 
 
 
245 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.5 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 
976 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 
276 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.18 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0657  Sel1 domain-containing protein  32.74 
 
 
439 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28201  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.61 
 
 
464 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34 
 
 
285 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  32.93 
 
 
213 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.78 
 
 
346 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
325 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 
325 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  30.57 
 
 
293 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.39 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.02 
 
 
1877 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.31 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  27.69 
 
 
509 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.26 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  34.18 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.5 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.5 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.66 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.5 
 
 
509 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.4 
 
 
731 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  32.44 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  31.12 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  31.05 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36.22 
 
 
763 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.54 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.86 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.19 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.81 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
1032 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  28.84 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>