More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0657 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0657  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
439 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28201  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  61.44 
 
 
245 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3333  Sel1 domain protein repeat-containing protein  62.04 
 
 
258 aa  206  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.542416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.5 
 
 
831 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 
303 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.24 
 
 
684 aa  123  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.65 
 
 
528 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.64 
 
 
838 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.3 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.03 
 
 
1402 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.76 
 
 
961 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.46 
 
 
489 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.36 
 
 
789 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 
685 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 
341 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.36 
 
 
557 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
393 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.7 
 
 
343 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.18 
 
 
1002 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.94 
 
 
416 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.43 
 
 
1493 aa  106  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.5 
 
 
235 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.9 
 
 
318 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.17 
 
 
490 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.17 
 
 
490 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.82 
 
 
232 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.81 
 
 
305 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.59 
 
 
325 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 
325 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.82 
 
 
376 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
1877 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
255 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 
464 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.56 
 
 
256 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.36 
 
 
376 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.03 
 
 
285 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.16 
 
 
329 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.07 
 
 
241 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.8 
 
 
271 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.69 
 
 
1037 aa  99.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.45 
 
 
315 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.5 
 
 
552 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
976 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.46 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.46 
 
 
327 aa  97.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 
1012 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.15 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 
193 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 
763 aa  94.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.05 
 
 
392 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  29.41 
 
 
304 aa  93.2  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.13 
 
 
482 aa  92.8  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
277 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.48 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 
246 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.45 
 
 
316 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  34.59 
 
 
276 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.46 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.16 
 
 
399 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.5 
 
 
346 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.33 
 
 
731 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  38.12 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.08 
 
 
222 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.93 
 
 
202 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.11 
 
 
278 aa  86.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.51 
 
 
293 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.99 
 
 
321 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.05 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.73 
 
 
2413 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  32.99 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 
746 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
274 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.13 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.62 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.91 
 
 
839 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
1032 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.47 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 
1261 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.54 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  24.6 
 
 
765 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.38 
 
 
1196 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.19 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.93 
 
 
890 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.55 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.91 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.77 
 
 
971 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  28.68 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
1430 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.66 
 
 
1059 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.06 
 
 
1110 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
971 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.95 
 
 
509 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>