More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2175 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  324  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  40.15 
 
 
489 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  42.15 
 
 
831 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  42.62 
 
 
961 aa  100  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
448 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  42.98 
 
 
684 aa  100  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.55 
 
 
490 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  43.08 
 
 
1402 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.81 
 
 
490 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.88 
 
 
393 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  41.8 
 
 
1032 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.98 
 
 
1493 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.5 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.61 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  43.31 
 
 
380 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.8 
 
 
789 aa  92.8  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.84 
 
 
208 aa  92  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  41.46 
 
 
2413 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
303 aa  91.3  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.98 
 
 
1002 aa  90.9  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.73 
 
 
329 aa  90.5  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.17 
 
 
685 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
181 aa  90.1  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  42.2 
 
 
256 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.09 
 
 
241 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.39 
 
 
232 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
252 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
223 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.83 
 
 
267 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36 
 
 
305 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.56 
 
 
557 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  41.88 
 
 
234 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.54 
 
 
838 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.76 
 
 
346 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 
318 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 
763 aa  85.1  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.15 
 
 
343 aa  84.3  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.02 
 
 
1877 aa  84.3  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  40.65 
 
 
552 aa  84  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 
416 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.19 
 
 
1037 aa  83.6  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.84 
 
 
731 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.91 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.71 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.69 
 
 
202 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.29 
 
 
373 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.29 
 
 
373 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  40.87 
 
 
271 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.75 
 
 
425 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  38.39 
 
 
218 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.07 
 
 
255 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.19 
 
 
341 aa  80.5  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.67 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  34.07 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  38.14 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  32.33 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.94 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  38.06 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  41.88 
 
 
438 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.13 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
976 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.94 
 
 
376 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  41.32 
 
 
357 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  33.52 
 
 
337 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  39.83 
 
 
971 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.61 
 
 
850 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  30.64 
 
 
245 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.07 
 
 
325 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.07 
 
 
325 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.61 
 
 
245 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 
528 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  39.32 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  38.71 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.97 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  32.82 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  37.31 
 
 
586 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.98 
 
 
971 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.74 
 
 
359 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.54 
 
 
342 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  32.8 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.84 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.21 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.04 
 
 
680 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  35.83 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  35.83 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 
1430 aa  75.1  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
274 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  35.83 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  41.49 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  36.76 
 
 
399 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  33.81 
 
 
252 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  35.48 
 
 
368 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.25 
 
 
285 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.11 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  35.48 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>