More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2104 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  343  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  54.93 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  55.4 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  57.89 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0743  Sel1-like  60.94 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.27 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  41.83 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  43.24 
 
 		 489 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  41.8 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.92 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  42.11 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  50.77 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  39.39 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  43.82 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1493 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  49.23 
 
 		 831 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.63 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.94 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  36.56 
 
 		 850 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.94 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  38.98 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.22 
 
 		 838 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.92 
 
 		 425 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.57 
 
 		 528 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  43.88 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 255 aa  67.4  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.05 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.67 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.7 
 
 		 961 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  40.19 
 
 		 1059 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.3 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  43.18 
 
 		 1078 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.24 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  38.64 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  43.18 
 
 		 1044 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  38.64 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.63 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  38.64 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  46.05 
 
 		 685 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  36.51 
 
 		 1086 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.23 
 
 		 789 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  41.96 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.53 
 
 		 684 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  38.64 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.17 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  43.75 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  39.18 
 
 		 368 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.25 
 
 		 316 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  39.53 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  43.75 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.8 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  37.36 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.88 
 
 		 1110 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  48.48 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1037 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  35.96 
 
 		 839 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.19 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  43.18 
 
 		 763 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  34.51 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  36.28 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.3 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  43.75 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.08 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.8 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1877 aa  62  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39 
 
 		 341 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.83 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.3 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1402 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  40.38 
 
 		 328 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  38.33 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  33.8 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  45.71 
 
 		 359 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.38 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  36.84 
 
 		 1105 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  31.85 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  54.1 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 1081 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  45 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.2 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.24 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  40.96 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  55.77 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  47.46 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  36.79 
 
 		 1134 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  44.78 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>