More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0047 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  81.74 
 
 
233 aa  347  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  80.09 
 
 
234 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  69.48 
 
 
250 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  69.48 
 
 
250 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  74.23 
 
 
258 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  73.71 
 
 
250 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  72.16 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  70.35 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  70.35 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  74.21 
 
 
258 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  73.68 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  73.4 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  72.87 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  72.11 
 
 
258 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  72.11 
 
 
258 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  72.11 
 
 
258 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  72.11 
 
 
258 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  48.07 
 
 
252 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.3 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.19 
 
 
248 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  45.98 
 
 
236 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  51.28 
 
 
249 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  41.85 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.22 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.49 
 
 
831 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.52 
 
 
557 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.6 
 
 
393 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.51 
 
 
1402 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.8 
 
 
684 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 
865 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 
318 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.47 
 
 
489 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.99 
 
 
1493 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 
789 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.72 
 
 
1037 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 
1032 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.49 
 
 
961 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.69 
 
 
2413 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
976 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
252 aa  101  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.01 
 
 
376 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.21 
 
 
731 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  41.61 
 
 
185 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.65 
 
 
235 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.95 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  35.53 
 
 
410 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.71 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.55 
 
 
305 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.26 
 
 
490 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  37.43 
 
 
376 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 
523 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.41 
 
 
838 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
448 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.13 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.97 
 
 
528 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
303 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.69 
 
 
342 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.95 
 
 
685 aa  95.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.39 
 
 
490 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  38.1 
 
 
365 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.71 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.72 
 
 
425 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.13 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.91 
 
 
380 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33 
 
 
241 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.34 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.13 
 
 
1002 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.17 
 
 
172 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.54 
 
 
373 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.41 
 
 
346 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.76 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.23 
 
 
329 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 
593 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 
416 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.4 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
1430 aa  88.2  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  35.44 
 
 
362 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 
341 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  39.86 
 
 
373 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.64 
 
 
1012 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  30.05 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.93 
 
 
380 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  35.52 
 
 
399 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  34.81 
 
 
362 aa  85.5  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.71 
 
 
1110 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  35.03 
 
 
591 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  35.33 
 
 
350 aa  85.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.36 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.94 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.54 
 
 
890 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.51 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.43 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.21 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.98 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.16 
 
 
680 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.25 
 
 
1078 aa  82  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>