More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2610 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  58.33 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  58.02 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0743  Sel1-like  60.94 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  58.91 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.83 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  38.61 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.64 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  35.83 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.17 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.82 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.32 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  52.05 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  43.53 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  49.32 
 
 		 831 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 		 763 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.09 
 
 		 489 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.35 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  38.46 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1493 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.2 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1358  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 		 258 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177099  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1037 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 685 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 		 528 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.09 
 
 		 482 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.87 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.24 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.67 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1402 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  42.39 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  35.42 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.57 
 
 		 684 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40 
 
 		 961 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.92 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  41.38 
 
 		 1044 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  36.21 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.75 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  41.38 
 
 		 1078 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.82 
 
 		 838 aa  62  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.71 
 
 		 329 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  38.82 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 305 aa  60.8  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.75 
 
 		 316 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.56 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  36.17 
 
 		 839 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2413 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  43.59 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  40.24 
 
 		 765 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35 
 
 		 425 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  47.95 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.87 
 
 		 552 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.16 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.53 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  43.84 
 
 		 731 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  43.06 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  41.3 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40 
 
 		 789 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.66 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  41.1 
 
 		 260 aa  57.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  36.04 
 
 		 403 aa  57.4  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.71 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.1 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.1 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.77 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.95 
 
 		 346 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.21 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.4 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  38.2 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  29.09 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.47 
 
 		 850 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.34 
 
 		 455 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.09 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1877 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.66 
 
 		 859 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.77 
 
 		 450 aa  54.7  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4087  Sel1 repeat-containing protein  32.65 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  33.03 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>