More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0326 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  311  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  43.17 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  42.74 
 
 		 241 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  44.92 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.09 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  39.83 
 
 		 295 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  45.22 
 
 		 425 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  49.44 
 
 		 2413 aa  87.4  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  41.38 
 
 		 256 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  42 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.37 
 
 		 254 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 448 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.62 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  32.86 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  40.77 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0743  Sel1-like  41.27 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.21 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  44.35 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  47.25 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.66 
 
 		 489 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  42.16 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  39.26 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  46.59 
 
 		 1493 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  47.13 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.79 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.09 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  46.15 
 
 		 557 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.55 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1037 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  42.7 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1002 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  48.31 
 
 		 831 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  43.96 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.46 
 
 		 961 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.3 
 
 		 528 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 		 255 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.42 
 
 		 393 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  43.52 
 
 		 403 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.44 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  46.07 
 
 		 1402 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.9 
 
 		 838 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  40.24 
 
 		 765 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  41.94 
 
 		 839 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  50.63 
 
 		 789 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.44 
 
 		 490 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  36.96 
 
 		 410 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  43.82 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  41.96 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  34.56 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  33.88 
 
 		 1086 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 		 341 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 763 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.21 
 
 		 270 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.83 
 
 		 255 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.68 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 359 aa  70.5  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.24 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 1196 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  39 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  38.02 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.92 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  39.37 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1796 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  35.14 
 
 		 1081 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.02 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  45.68 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  44.32 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.64 
 
 		 684 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  43.82 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  42 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  44.32 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  44.32 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  35.71 
 
 		 1134 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  44.32 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  44.32 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.17 
 
 		 1263 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1059 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  36.61 
 
 		 1105 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  42.05 
 
 		 399 aa  67.8  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  44.44 
 
 		 438 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  37.86 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.71 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1110 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  41.86 
 
 		 260 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.84 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.76 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39.56 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  46.75 
 
 		 505 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  37.9 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.87 
 
 		 890 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.11 
 
 		 552 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>