More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4119 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.88 
 
 		 789 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  42.11 
 
 		 961 aa  108  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.34 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  44.17 
 
 		 684 aa  103  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.77 
 
 		 489 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.37 
 
 		 346 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 		 831 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  46.51 
 
 		 416 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  43.31 
 
 		 305 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  42.19 
 
 		 260 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.15 
 
 		 1402 aa  99  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 		 448 aa  98.6  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  40.61 
 
 		 393 aa  98.6  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.76 
 
 		 245 aa  97.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.61 
 
 		 557 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.96 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 		 252 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1493 aa  95.5  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  42.42 
 
 		 425 aa  95.5  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1002 aa  94.4  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.26 
 
 		 2413 aa  93.6  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  42.98 
 
 		 552 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  39.23 
 
 		 342 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.81 
 
 		 318 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.97 
 
 		 373 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.97 
 
 		 373 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.44 
 
 		 255 aa  91.3  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  39.39 
 
 		 254 aa  90.9  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.69 
 
 		 278 aa  90.9  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1037 aa  90.9  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.77 
 
 		 528 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.68 
 
 		 376 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  37.68 
 
 		 376 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.11 
 
 		 241 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.53 
 
 		 341 aa  88.2  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  39.42 
 
 		 221 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.31 
 
 		 264 aa  87.4  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.15 
 
 		 343 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  41.35 
 
 		 509 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40.88 
 
 		 509 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  40.88 
 
 		 509 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.03 
 
 		 838 aa  87  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  86.3  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  41.35 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.88 
 
 		 490 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.91 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36.76 
 
 		 763 aa  86.3  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.4 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.95 
 
 		 256 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  39.06 
 
 		 380 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.06 
 
 		 271 aa  85.5  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  41.07 
 
 		 410 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.68 
 
 		 490 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  36.84 
 
 		 329 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  39.13 
 
 		 586 aa  84  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  40.37 
 
 		 117 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1877 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  34.01 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  29.59 
 
 		 647 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.88 
 
 		 850 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  31.45 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.51 
 
 		 839 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.41 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.21 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 685 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  37.12 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  38.52 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.36 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.58 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  40.58 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  37.12 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  37.12 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  41.13 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 1032 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  40.3 
 
 		 679 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.28 
 
 		 359 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.34 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.12 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.52 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 1012 aa  77.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  37.3 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.76 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.51 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.85 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1059 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 325 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  35.77 
 
 		 337 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>