More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2980 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.84 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.41 
 
 		 359 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.53 
 
 		 315 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.99 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.83 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.74 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.43 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.47 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.8 
 
 		 961 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  43.62 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.82 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.35 
 
 		 490 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  39.05 
 
 		 1059 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 		 2413 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.59 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  39.64 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.14 
 
 		 1086 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 1072 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.17 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.72 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.85 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  39.83 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 1226 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.67 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.48 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 1012 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.4 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.15 
 
 		 831 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.58 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.58 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.84 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.67 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.59 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.33 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1402 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1002 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.3 
 
 		 190 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1141 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 1263 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.31 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.69 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  34 
 
 		 1160 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 		 1430 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1037 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1877 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.05 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.16 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  31.01 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1493 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.29 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  38.02 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  31.97 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.56 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 976 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.51 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.77 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  35.77 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1032 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  28.48 
 
 		 1105 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  31.75 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 685 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.04 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.81 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.25 
 
 		 1344 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 1081 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 481 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.92 
 
 		 838 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  36.52 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  35.58 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  27.03 
 
 		 1105 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.74 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  27.21 
 
 		 1134 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1110 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 1261 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.88 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  34.4 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.19 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.91 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  29.33 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  33.06 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  35.83 
 
 		 839 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  30.95 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  35.43 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.62 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.38 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  33.06 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  32.89 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  30.95 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.87 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>