More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4343 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  95.6 
 
 		 182 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  79.89 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  73.63 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  72.53 
 
 		 182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  69.66 
 
 		 181 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  74.32 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  71.98 
 
 		 182 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  72.68 
 
 		 181 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  72.68 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  72.68 
 
 		 181 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.85 
 
 		 246 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  37.14 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.62 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.85 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.96 
 
 		 789 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  39.36 
 
 		 552 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.11 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 831 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  41.49 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1402 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.78 
 
 		 684 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40.48 
 
 		 961 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  38.54 
 
 		 765 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  37.08 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.86 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.77 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.77 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  36.84 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  42.45 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.1 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.47 
 
 		 865 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.48 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  34.91 
 
 		 247 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.67 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.25 
 
 		 490 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.25 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  38.38 
 
 		 410 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  38.71 
 
 		 342 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.71 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 528 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.96 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31.06 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  28.36 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.13 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 1012 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.17 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.7 
 
 		 2413 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.79 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1344 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 		 1475 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.67 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  34.04 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.89 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.96 
 
 		 731 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.47 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1088 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  42.11 
 
 		 647 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.38 
 
 		 811 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1877 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.09 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.05 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  35.05 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.36 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  35.05 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  37.21 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.57 
 
 		 557 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.59 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 1430 aa  58.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  35.78 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1002 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  35.79 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 450 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>