More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2107 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  56.9 
 
 
720 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  57.04 
 
 
720 aa  864    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  98.89 
 
 
722 aa  1479    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  98.75 
 
 
722 aa  1479    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
722 aa  1500    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  56.9 
 
 
720 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  98.89 
 
 
722 aa  1479    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  43.07 
 
 
831 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  42.75 
 
 
684 aa  101  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 
393 aa  97.8  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.36 
 
 
557 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.71 
 
 
318 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.51 
 
 
380 aa  95.1  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.87 
 
 
329 aa  94.7  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  42.18 
 
 
373 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  42.36 
 
 
373 aa  92.8  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.42 
 
 
961 aa  92.8  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.85 
 
 
235 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.18 
 
 
267 aa  91.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.27 
 
 
1493 aa  90.1  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  27.33 
 
 
454 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40 
 
 
1402 aa  88.6  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
255 aa  89  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  29.12 
 
 
291 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.84 
 
 
489 aa  88.2  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.88 
 
 
376 aa  87.8  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.14 
 
 
838 aa  87.8  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.14 
 
 
416 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.9 
 
 
789 aa  87.8  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.64 
 
 
208 aa  87.8  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
448 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.89 
 
 
2413 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.88 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  39.6 
 
 
276 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  27.89 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.75 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.81 
 
 
890 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.63 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.69 
 
 
1002 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.25 
 
 
490 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.57 
 
 
685 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.36 
 
 
232 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  32.74 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.58 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  32.74 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39.52 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 
211 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  32.74 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  29.77 
 
 
534 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.21 
 
 
490 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  32.74 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.97 
 
 
1037 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.65 
 
 
552 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  37.23 
 
 
746 aa  81.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  23.62 
 
 
838 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.04 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.25 
 
 
770 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25 
 
 
759 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.78 
 
 
392 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  26.82 
 
 
691 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.64 
 
 
359 aa  80.1  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
505 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  23.62 
 
 
838 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.16 
 
 
256 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  24.3 
 
 
571 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.36 
 
 
680 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.17 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  26.9 
 
 
746 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 
865 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  23.3 
 
 
838 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  38.21 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
1032 aa  77.4  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  26.06 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 
255 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.12 
 
 
241 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.93 
 
 
185 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  23 
 
 
768 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
181 aa  77  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
223 aa  76.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.69 
 
 
770 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 
380 aa  77  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  32.48 
 
 
328 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  34.31 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.59 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.77 
 
 
305 aa  76.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.69 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  23.62 
 
 
836 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  29.07 
 
 
755 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 
234 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.59 
 
 
1877 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  35.29 
 
 
1160 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  34.31 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.89 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  34.31 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.72 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>