75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0836 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1550    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  62.32 
 
 
836 aa  1012    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  57.47 
 
 
759 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  62.78 
 
 
838 aa  1018    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  57.42 
 
 
757 aa  874    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  62.05 
 
 
838 aa  1021    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  62.05 
 
 
838 aa  1018    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  58.09 
 
 
755 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  57.96 
 
 
755 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.16 
 
 
530 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  27.93 
 
 
722 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  27.93 
 
 
722 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  25.08 
 
 
720 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  25.61 
 
 
720 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.08 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  26.96 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  24.32 
 
 
769 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  22.19 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  26.64 
 
 
722 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.9 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  25.5 
 
 
534 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.89 
 
 
769 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25.36 
 
 
621 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.78 
 
 
691 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.89 
 
 
769 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  23.74 
 
 
770 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  24.48 
 
 
770 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  24.48 
 
 
770 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.23 
 
 
770 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  24.66 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  23.43 
 
 
770 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  31.06 
 
 
203 aa  65.1  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  37.14 
 
 
566 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  25.32 
 
 
361 aa  62.4  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  34.62 
 
 
566 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.13 
 
 
449 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  21.37 
 
 
226 aa  60.1  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  34.17 
 
 
188 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  35.24 
 
 
566 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.83 
 
 
768 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.69 
 
 
772 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  28.18 
 
 
576 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  28.18 
 
 
576 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  24.9 
 
 
300 aa  54.7  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  27.07 
 
 
576 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  27.07 
 
 
577 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  27.35 
 
 
171 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  24.34 
 
 
566 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  29.55 
 
 
566 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.5 
 
 
519 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  27.07 
 
 
580 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.72 
 
 
566 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  27.07 
 
 
577 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  25.1 
 
 
327 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  27.49 
 
 
577 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  27.07 
 
 
566 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  31.76 
 
 
404 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  27.07 
 
 
577 aa  51.2  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  30.65 
 
 
440 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  28 
 
 
332 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  26.47 
 
 
187 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  23.67 
 
 
602 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  27.46 
 
 
197 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  30.08 
 
 
180 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  25.49 
 
 
240 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  25.45 
 
 
178 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  22.78 
 
 
274 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  24.39 
 
 
576 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  25.45 
 
 
178 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  20.9 
 
 
571 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  40.38 
 
 
239 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  23.14 
 
 
351 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  24.76 
 
 
159 aa  45.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  29.75 
 
 
238 aa  44.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.05 
 
 
566 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>