40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6134 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  28.41 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  28.24 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  28.43 
 
 		 691 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  28.57 
 
 		 454 aa  54.7  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  26.15 
 
 		 772 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5579  hypothetical protein  38.57 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  25.49 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.32 
 
 		 769 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  29.46 
 
 		 768 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  25.41 
 
 		 722 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25.41 
 
 		 722 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  26.47 
 
 		 746 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  23.81 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.41 
 
 		 722 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.41 
 
 		 722 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  26.17 
 
 		 755 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 759 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 		 757 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.49 
 
 		 770 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  23.68 
 
 		 838 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  23.68 
 
 		 838 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  23.68 
 
 		 838 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  23.68 
 
 		 836 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  29.7 
 
 		 720 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.7 
 
 		 720 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.63 
 
 		 530 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.19 
 
 		 770 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  29.59 
 
 		 769 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  29.59 
 
 		 769 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.47 
 
 		 770 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.7 
 
 		 720 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  26.19 
 
 		 770 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.23 
 
 		 590 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.37 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  29.59 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.47 
 
 		 770 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 351 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.44 
 
 		 755 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.37 
 
 		 332 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>