84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1603 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 590 aa  1157    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  31.03 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.53 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36 
 
 		 369 aa  54.3  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  21.38 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  26.11 
 
 		 768 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.82 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  21.01 
 
 		 274 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  20 
 
 		 171 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6396  hypothetical protein  23.65 
 
 		 357 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.71 
 
 		 446 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  38.75 
 
 		 488 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.59 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  32.56 
 
 		 757 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  27.27 
 
 		 838 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.88 
 
 		 770 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  27.27 
 
 		 836 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.88 
 
 		 770 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  44.44 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  21.09 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  27.27 
 
 		 838 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  28.57 
 
 		 772 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  27.27 
 
 		 838 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  23.62 
 
 		 769 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  22.29 
 
 		 691 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1393  stage IV sporulation protein B  32.91 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  45.59 
 
 		 1090 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  23.36 
 
 		 770 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  22.83 
 
 		 769 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  22.06 
 
 		 770 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  29.35 
 
 		 356 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  26.43 
 
 		 722 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  26.43 
 
 		 722 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  28.87 
 
 		 759 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  23.31 
 
 		 770 aa  47  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.67 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.39 
 
 		 769 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  22.3 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  31.4 
 
 		 755 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.62 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.43 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.43 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.3 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.43 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  30.53 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  22.47 
 
 		 770 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.24 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  33.33 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  31.4 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1336  stage IV sporulation protein B  30.88 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  33.33 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  38.89 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0118  RIP metalloprotease RseP  27.5 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  44.26 
 
 		 673 aa  45.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  29.63 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  25.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  23.47 
 
 		 357 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  35.05 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  40.32 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  38.89 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  44.44 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  44.44 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  44.44 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 		 456 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  41.94 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  43.4 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  41.94 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  43.4 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  27.27 
 
 		 417 aa  43.9  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  36.26 
 
 		 495 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  35.38 
 
 		 347 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  24.49 
 
 		 361 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  31.96 
 
 		 502 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  28.89 
 
 		 479 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  23.14 
 
 		 300 aa  43.5  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>