23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5689 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  732    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3784  hypothetical protein  43.2 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0473  hypothetical protein  41 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  29.79 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  32.82 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  32.82 
 
 		 770 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  32.82 
 
 		 770 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  32.82 
 
 		 770 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  28 
 
 		 769 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  29.23 
 
 		 770 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  29.35 
 
 		 691 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  30.88 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  29.77 
 
 		 769 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  29.77 
 
 		 769 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  25.15 
 
 		 262 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  29.37 
 
 		 770 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  30.3 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  31.82 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  27.55 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  28.3 
 
 		 171 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.47 
 
 		 590 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25.9 
 
 		 621 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>