99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1002 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  77.92 
 
 		 770 aa  1272    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  77.92 
 
 		 770 aa  1271    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  55.38 
 
 		 769 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  44.56 
 
 		 768 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  87.4 
 
 		 770 aa  1396    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  53.91 
 
 		 772 aa  835    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  89.19 
 
 		 769 aa  1418    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  88.54 
 
 		 769 aa  1408    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  77.79 
 
 		 770 aa  1267    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  78.44 
 
 		 770 aa  1273    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1581    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  25.21 
 
 		 691 aa  184  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26.4 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.44 
 
 		 530 aa  124  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.76 
 
 		 291 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  27.24 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  28.66 
 
 		 449 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  28.91 
 
 		 332 aa  89.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  25.16 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  26.87 
 
 		 454 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.16 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.81 
 
 		 829 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  26.12 
 
 		 829 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.06 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.98 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.98 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  23.8 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  25.64 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  25.98 
 
 		 722 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  22.52 
 
 		 720 aa  78.2  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  23.99 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  25.91 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  23.74 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  22.22 
 
 		 720 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  25.5 
 
 		 829 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25.38 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  24.14 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  26.64 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  24.05 
 
 		 818 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  30.19 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.52 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25.68 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  26.75 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  30.72 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  26.77 
 
 		 173 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  24.78 
 
 		 838 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  23.95 
 
 		 566 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  23.76 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.22 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  25.29 
 
 		 838 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  33.56 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  24.63 
 
 		 838 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  25.88 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  24.6 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  23.83 
 
 		 566 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  24.73 
 
 		 755 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  21.38 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  25.13 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  23.43 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  24.22 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  22.7 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  25.45 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  24.24 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  24.12 
 
 		 816 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  23.82 
 
 		 836 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  22.43 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  23.77 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  23.85 
 
 		 816 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  31.76 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.88 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  22.55 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  28.09 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  23.03 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  25.79 
 
 		 576 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  24.88 
 
 		 577 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  33.65 
 
 		 171 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  26.51 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  22.75 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 181 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  25.31 
 
 		 576 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  25.43 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  26.71 
 
 		 230 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  25.19 
 
 		 134 aa  54.3  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  27.72 
 
 		 108 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  42.03 
 
 		 262 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  28.43 
 
 		 188 aa  52.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  31.13 
 
 		 203 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  21.02 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  29.23 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.9 
 
 		 590 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5435  MORN repeat-containing protein  30.86 
 
 		 116 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.416219  normal  0.0770205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  25.74 
 
 		 159 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  30.86 
 
 		 351 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  20.54 
 
 		 351 aa  45.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>